Yaşam Bilimlerinde Veri Analizi
2023-02-03
NCBI dizi okuma arşivindeki veri miktarının artışı
Deprem verisini analiz etmek ister misiniz?
Harfleri:
Notaları
Kedileri?
Gri tonlama
DNA’yı:
TCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGC TAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTA GCTAGCTAGTCAGTCGTACGTA GCTAGCTAGCTAGCTAGTCGAT CGATCA
Proteinleri:
QYINQSICIIYYMCTIKFSLWF LPGTKVCRCPVIQYDKFTRGYG LACTEEVATAQRYSRTIVRLWC EPKNRHCRGRDKNEGSLHASMF YQDTCWDDPYRLFKERYRCMPT NAQLTWTYYW
Veriler bilgisayarlar yardımıyla işlenir
Bir konumdan başka bir konuma iletilir ve ve dönüştürülmesi
Verilerin uzun süreli depolanması
Bilgisayarın temel bilgi işleme birimi.
Bütün parçalar arasındaki koordinasyonu sağlamaktan sorumlu
Bir orkestra şefi gibi
Rastgele hafıza erişimi (Random Access Memory).
Bilgisayardaki birincil hafıza birimi. Sadece aktif olarak kullanılan veriler depolanır.
Ancak kısa süreldir ve kalıcılığı yoktur. Enerji kesildiğinde silinir.
İkincil depolama birimi olarak kullanılır.
Uzun süreli bir depolama sağlar.
Ucuz ancak yavaş bir depolama birimi.
Sayıları depoladığımız listeler. Her dosyanın:
bulunur
Bir karakter listesi:
Aşağıdakiler hariç:
Unix/Linux sistemlerde büyük ve küçük harfler farklıdır.
Her dosyanın uzantısı vardır (zorunlu değil ama anlaşılmayı kolaylaştırır):
Temel olarak iki tip dosya var:
En basit metin gösterim metodu her bir karakteri tek bir bit ile ifade etmek
İngilizce için ASCII isimli bir kodlama var
Sıfır - 127 arasındak her numara bir sembol veya bir sinyal olarak ifade edilir:
| 30 | 40 | 50 | 60 | 70 | 80 | 90 | 100 | 110 | 120 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 0 | ( | 2 | < | F | P | Z | d | n | x | |
| 1 | ) | 3 | = | G | Q | [ | e | o | y | |
| 2 | 4 | > | H | R | \ | f | p | z | ||
| 3 | ! | + | 5 | ? | I | S | ] | g | q | { |
| 4 | ” | , | 6 | @ | J | T | ^ | h | r | | |
| 5 | # | - | 7 | A | K | U | i | s | } | |
| 6 | $ | . | 8 | B | L | V | ` | j | t | ~ |
| 7 | % | / | 9 | C | M | W | a | k | u | |
| 8 | & | 0 | : | D | N | X | b | l | v | |
| 9 | ´ | 1 | ; | E | O | Y | c | m | w |
Non-English languages use numbers between 128 and 255 for symbols like “Ç”, “Ö”, “É”, “Ñ”
Yaşam Bilimlerinde Veri Analizi